یکی از بزرگ‌ترین چالش‌های پیش رو برای جامعه بشری بحران غذا، مسئله امنیت و سلامت غذا به‌تناسب جمعیت روبه‌افزایش دنیا است. ازیک‌طرف افزایش جمعیت و از طرفی دیگر کمبود مواد اولیه تولید سبب شده تا طی دهه‌های اخیر، کشاورزی از حالت سنتی به حالت گسترده صنعتی درآید. باتوجه‌به این مسئله که دانه برنج 40 درصد غذای نیمی از مردم جهان است، کشف بهترین روش کشت برنج می‌تواند سبب کاهش اثرات سوء تاثیر کشت برنج بر محیط زیست شود. استفاده بی‌رویه و نامناسب از سموم و کودهای شیمیایی در مراحل مختلف کشاورزی صنعتی بشر را با چالش‌های مختلف و جدیدی مواجه کرده است. ظهور امراض جدید و مقاوم شدن گونه‌های آفات و پسماند سموم در خاک اثرات نامطلوبی روی موجودات خاکزی داشته و در صورت جذب توسط گیاهان به زنجیره غذایی ورود پیدا می‌کند؛ این مسئله سبب ایجاد اثرات سوء برای گیاهان، انسان و سایر جانداران می‌شود.
تمام موارد بیان شده منجر می‌شود تا کشاورزی تأثیرات مضر بر روی محیط‌زیست به‌جای بگذارد. کشاورزی غیراصولی اثرات مختلفی بر پیکره زمین و محیط‌زیست به جا می‌گذارد؛ بنابراین کشت برنج با روش های سازگار با محیط زیست از اهمیت بالایی برخوردار است که توجه به آن می‌تواند موجب کاهش این اثرات سوء بر محیط‌زیست و جانداران شود.
باتوجه‌به اهمیت برنج به‌عنوان غذای اصلی که نسبت به هر ماده غذایی دیگر مزایای زیادی برای جمعیت جهان دارد، توجه به مسئله تاثیر کشت برنج بر محیط زیست با روش های سازگار با محیط زیست از اهمیت بسیاری برخوردار است. محققان روش‌هایی را برای شیوه‌های کشاورزی پیشنهاد می‌دهند که سازگار با محیط‌زیست باشد تا تاثیر کشت برنج بر محیط زیست و تغییرات اقلیمی کمتر شود. تحقیقات نشان‌دهنده این موضوع است که 2.5 درصد از تغییرات اقلیمی به کشت برنج مربوط است.
مشکل اصلی گاز متان است که باکتری‌های موجود در خاک اشباع شده از آب، این گاز گلخانه‌ای قوی را در مقیاس بزرگ تولید می‌کنند. نیتروز اکساید یا مونوکسید دی نیتروژن گاز دیگری است که در شالیزارها تولید می‌شود. سازمان بین‌المللی برای حل بخشی از مشکل تأثیر کشت برنج بر محیط زیست، آبیاری غرقابی را پیشنهاد می‌کند؛ اما این روش هم مشکلات خاص خود را دارد. دانشمندان برای حل این مشکل هر مزرعه را به طور جداگانه در نظر گرفته و میزان گاز متان و نیتروز اکساید تولید شده و آب مصرفی را بررسی کرده‌اند. به اعتقاد آن‌ها با استفاده از استراتژی‌های مشخص می‌توان نشر گازهای مضر را کاهش داد.
کشت برنج با روش های سازگار با محیط زیست می‌تواند به حفظ منابع طبیعی و حداقل کردن تأثیرات منفی بر محیط زیست کمک کند. چند روش سازگار با محیط زیست برای کشت برنج عبارت‌اند از:
در کشت مستقیم بذرهای برنج بدون نیاز به پیشروی در مزرعه، مستقیماً در زمین کاشته می‌شوند. کاهش هدررفت آب، کاهش مصرف سوخت و انرژی و کاهش آلودگی محیط زیست از مزایای خوب این روش هستند.
استفاده از مواد آلی به‌جای کودهای شیمیایی می‌تواند خاک را حفظ کرده و به بهبود ساختار خاک کمک کند. کودهای آلی مانند کودهای کمپوست، سبزیجات خشک و کمپوست نشاسته‌ای را می‌توان در کشت برنج با روش های سازگار با محیط زیست استفاده کرد که تاثیر کشت برنج بر محیط زیست را از جنبه منفی کمتر می‌کند.
